Se você já jogou os jogos clássicos do Mega Man, então você sabe o quão desafiador eles podem ser. A terceira parcela introduz uma nova mudança de slide para o Mega Man e sua corrida de companheiros caninos. O jogo também adiciona uma nova dimensão ao personagem, e é por isso que você quer jogá-lo em 2D! No entanto, uma das suas falhas mais significativas é que são gráficos datados, que são menos do que stellar pelos padrões de hoje.
Enquanto os controles são os mesmos que os jogos mega manuais, este jogo leva a jogabilidade um passo adiante. O jogo é um jardineiro clássico de rolagem lateral, no qual você pula de tijolo para tijolo, evite pits e atirar em robôs. Você também terá um SideKick, o que permite que você deslize enquanto evita inimigos e armadilhas. Embora esta história de títulos seja bastante genérica e não tenha profundidade, a mecânica compensa por isso.
Mega Man 3 possui um estilo de plataforma, com muitos elementos de jogo de ação. Você controlará o protagonista, mega homem, como ele faz o seu caminho através de oito etapas selecionáveis. Ao longo do caminho, você encontrará vários power-ups que você pode usar para combater os inimigos, como um escudo e um lançador de foguetes. No final, você vai enfrentar o infame Robot Master, que tentará tornar o jogo impossível.